影片以1945为时代背景，所谓“暴风女神”就是日本潜水艇伊507号上配置的尖端探测系统，当时美国向日本广岛投下原子弹，第二次世界大战已经接近尾声。

日本方面为了防止美国再次使用原子弹攻击，而制定下了反击计划，意图摧毁美军的原子弹发射基地。

海军上校浅仓奉命执行，而他手中的王牌就是由德国制造，具有最先进攻击力的战斗潜水艇“伊507”，浅仓将与年青部下绢见少校一起为扭转战争局势而做着最后的殊死努力。