主角风见志郎目睹邪恶组织「迪斯特龙」将其全家杀害，当他被迪斯特龙派来的怪人袭击时，他的学长本乡猛及时变身假面骑士赶到，并与2号一文字隼人联手将他救出，其后，志郎要求两位假面骑士让他成为改造人为家人报仇，但1号与2号却因为不希望再让他人承受身为改造人的痛苦，而拒绝了志郎的要求。
之后，假面骑士1、2号潜入迪斯特龙基地。志郎随后追踪，当两位假面骑士误闯陷阱时，志郎及时前来搭救，但他却被迪斯特龙的改造人破坏光线所击中，身受重伤。为了拯救志郎的性命，两人别无选择，就在基地内将他改造，当手术完成，迪斯特龙的炮龟怪人却也一砲将基地轰毁，及时逃出的1号与2号陷入苦战时，改造完成的志郎＝V3及时现身支援。但最后1号与2号则将意图自爆的炮龟怪人一起带进高空，消失於大爆炸中。以为两位骑士已经牺牲的风见志郎，决心继续两人的遗志（但之后则确认1号与2号平安无事）成为假面骑士V3，与迪斯特龙周旋到底。